Bioquímica y Biología Molecular
de las Micobacterias - BBMM

Código: COL0056968

Líder del grupo: CARLOS YESID SOTO OSPINA

Departamento: QUÍMICA

Líneas de investigación:

Enzimas y sistemas de transporte de membrana en bacterias

• Búsqueda de genes y caracterización de enzimas con función ATPasa en las micobacterias
• Estudio de la actividad H+-ATPasa de las micobacterias
• Influencia de las condiciones de estrés (hipoxia e inanición) en el intercambio protónico y la homeostasis iónica de las micobacterias

Virulencia y latencia de las micobacterias

• Búsqueda de marcadores genómicos y lipídicos relacionados con la latencia de M. tuberculosis.
• Estudio de factores de virulencia de M. tuberculosis en pared celular y membrana plasmática.

Compuestos antimicobacterianos

• Actividad de péptidos antibióticos contra M. smegmatis y M. tuberculosis H37Ra
• Búsqueda de mecanismos de acción de péptidos antibióticos a nivel de membrana plasmática. Se pretende en un futuro estudiar la actividad antimicobacteriana de distintas sustancias orgánicas.
• Búsqueda de dianas terapéuticas en micobacterias.
• Estudio de las ATPasas de membrana plasmática, como posibles dianas sensibles en micobacterias y su papel en la resistencia antibiótica e infección latente.

Bioinformática

• Diseño mediante bioinformática y síntesis química de péptidos antimicrobianos con potencial utilidad antituberculosa.
• Aplicación de métodos quimioinformáticos para identificación de inhibidores de actividad ATPasa tipo P.
• Genómica y transcriptómica en el estudio de las infecciones causadas por Mycobacterium leprae.

Vacunas

• Diseño de mutantes atenuados de M. tuberculosis

Infecciones zoonóticas

• En el grupo BBMM llevamos los últimos años incursionando en el diagnóstico molecular de enfermedades zoonóticas frecuentes en la región del Sumapaz en Cundinamarca, Colombia, tales como la brucelosis y tuberculosis bovina producidas por Brucella abortus y Mycobacterium bovis, respectivamente. El principal objetivo es transferir este tipo de diagnóstico a pequeños y medianos productores agropecuarios para facilitar su prevención y reducir el impacto en la producción de leche y carne de la región.

Proyectos Línea Infecciones Zoonóticas:

• Diagnóstico molecular de Brucella abortus y Mycobacterium bovis en sistemas de producción ganaderos en la región de Sumapaz, Colombia.



• Prototipo "Point of Care" para el diagnóstico de tuberculosis bovina.



• Diagnóstico en campo de tuberculosis bovina en la región de Sumapaz. Fase 2: evaluación y validación de un método rápido basado en amplificación isotérmica.



• Fortalecimiento del sistema nacional de medidas sanitarias mediante el desarrollo de herramientas metrológicas basadas en PCR para el diagnóstico de tuberculosis y brucelosis bovina

Participantes Línea Infecciones Zoonóticas:

• Carlos Yesid Soto Ospina - Universidad Nacional de Colombia
  
  Gina Marcela López Ruiz - Universidad Nacional de Colombia
  
  Edgar Alfredo Díaz Pérez - Universidad Nacional de Colombia
  
  Laura Marcela Gomez Alfonso - Universidad Nacional de Colombia
  
  Danna Sofía Camelo Gomez - Universidad Nacional de Colombia
  
  Nelson Alejandro Sierra Cortés - Universidad Nacional de Colombia
  
  Wendy Nathaly Rueda Uscategui - Universidad Antonio Nariño
  
  Nelson Enrique Arenas Suarez - Universidad Antonio Nariño
  
  Vilma Moreno Melo - Universidad de Cundinamarca
  
  Diego Andrés Abril Herrera - Universidad de Cundinamarca
  
  Bibiana Chavarro Portillo - Centro Dermatológico Federico Lleras Acosta
  
  Martha Inírida Guerrero - Centro Dermatológico Federico Lleras Acosta
  
  John Emerson Leguizamón Guerrero - Instituto Nacional de Metrología
  
  

Programas

• Pregrado en Química
• Pregrado en Biología
• Pregrado en Farmacia
• Maestría en Ciencias-Química
• Maestría en Ciencias-Bioquímica
• Maestría en Ciencias-Microbiología
• Doctorado en Ciencias-Química
• Doctorado en Ciencias-Bioquímica
• Doctorado en Biotecnología
• Doctorado en Ciencias Biomédicas (Medicina)

Integrantes

Docentes Asociados

Martha Nancy Calderón

Profesora Asistente

Químico, 1994. Universidad Nacional de Colombia. Ph.D, Química, 2011. Universidad Nacional de Colombia.

Áreas de investigación: Bioquímica en estrés oxidativo y proteómica.

Oficina: Edificio 451 Oficina 449 Correo: mncalderono@unal.edu.co Teléfono: 3165000 Ext. 14485

Luz Mary Salazar Pulido

Profesora Asociada

Químico, 1982. Universidad Nacional de Colombia. Ph.D, Ciencias Química, 2003. Universidad Nacional de Colombia.

Áreas de investigación: Resonancia Magnética Nuclear de Péptidos y Proteínas, Cálculo de estructura Tridimensional de Péptidos y Proteínas, Relación Estructura-Función, Docking Molecular.

Oficina:Edificio 451 Oficina 423 Correo: lmsalazarpu@unal.edu.co Teléfono: 3165000 Ext. 14449

Luis Ramón Osses Basaure (QEPD)

Mención Especial

Bioquímico, 1975; Universidad De Santiago De Chile

M. Sc, Magister en Biología, 1981; Instituto Venezolano De Investigaciones Científicas - Laboratorio De Ecofisiología (Venezuela).

Ph. D, Doctorado En Biología, 1984; Instituto Venezolano De Investigaciones Científicas - Laboratorio De Ecofisiología (Venezuela).

Nelson Enrique Arenas Suarez

Profesor Asociado Universidad Antonio Nariño

Licenciado en Ciencias con especialidad en biología y educación ambiental,2004; Universidad del Quindio.

M.Sc Magister en Ciencias Bioquímicas,2009; Universidad Nacional de Colombia

Ph. D, Doctorado en Bioquímica y Biología Molecular, 2015. University Of Southern Denmark

Áreas de investigación: Resistencia a antibióticos, identificación molecular y caracterización de patógenos, tuberculosis y producción animal con énfasis en producción limpia.

Posiciones Posdoctorales

• 

  Milena Maya Hoyos

  Química, 2010. Universidad Nacional de Colombia MSc. Bioquímica, 2013. Universidad Nacional de Colombia Estudiante de Doctorado en Ciencias-Bioquímica
  
  Áreas de investigación: Bioquimica y biología molecular de las micobacterias, virulencia y latencia de las micobacterias.
  
  Correo: mmayah@unal.edu.co
  
  
  
  
  

• 

  Paola Andrea Santos Ruiz

  Bacterióloga,1999.Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca MSc, 2010. Maestría en Ciencias- Bioquímica. Universidad Nacional de Colombia Ph. D, 2020. Doctorado en Ciencias- Bioquímica. Universidad Nacional de Colombia
  
  Áreas de investigación: Bioquímica, Microbiología, Biología Celular y Bioinformática
  
  Correo: pasantosr@unal.edu.co
  
  
  
  
  

Estudiantes de Doctorado

• 

  John Emerson Leguizamon Guerrero

  Estudiante de Doctorado

  Profesional Especializado Instituto Nacional de Metrología.
  
  Grupo de Metrología en Bioanálisis, Subdirección de Metrología Química y Biomedicina-INM.
  
  Áreas de investigación:
  
  Desarrollo de herramientas de aseguramiento de la calidad de las mediciones como métodos de medición, materiales de referencia, estudios interlaboratorio, asociados a técnicas de cuantificación de biomoléculas de interés, en particular ácidos nucleicos.
  
  Correo: jeleguizamon@inm.gov.co
  
  

• 

  Gina Marcela López Ruiz

  Estudiante de Doctorado

  Química, 2012. Universidad Nacional de Colombia Estudiante de Maestría en Ciencias-Bioquímica
  
  Áreas de investigación:
  
  Bioquimica y Biología Molecular de las micobacterias, enzimas y sistemas de transporte de membrana en bacterias, compuestos antimicobacterianos.
  
  Correo: gmlopezr@unal.edu.co
  
  
  
  

• 

  Viviana Chabarro

  Paola Andrea Santos Ruiz

  Estudiante de Doctorado

  Bacterióloga, 2000. Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca Esp. Bioquímica Clínica, 2004. Pontificia Universidad Javeriana MSc. Bioquímica, 2011. Universidad Nacional de Colombia Estudiante de Doctorado en Ciencias-Bioquímica
  
  Áreas de investigación: Bioquímica y biología molecular de las micobacterias, diseño de compuestos antituberculosos, proteínas de membrana de las micobacterias .
  
  Correo: pasantosr@unal.edu.co
  
  

Estudiantes de Maestría

• 

  Vanessa Vasquez Godoy

  Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímica.

  Licenciada en Química. Universidad Distrital Francisco José de Caldas 2015. Universidad Nacional de Colombia.
  
  Áreas de investigación: Biología Molecular de las Micobacterias.
  
  Correo: vavasquezgo@unal.edu.co
  
  
  
  

• 

  Henry Andrés Varón Vega

  Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímica.

  Químico, 2018. Universidad Nacional de Colombia.
  
  Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímica.Universidad Nacional de Colombia.
  
  Áreas de investigación:
  Inhibición de ATPasas
  
  Correo: havaronv@unal.edu.co
  
  
  

• 

  Manuel Orlando Figueroa Castillo

  Estudiante de Maestría en Ciencias Microbiología.

  Quimico Farmaceutico. Universidad de Colombia 2018
  
  Instituto Nacional de Vigilancia de Medicamentos y Alimentos INVIMA 2018
  
  Hospital Universitario Nacional de Colombia 2019
  
  Jefe del Servicio Farmacéutico. Hospital Universitario Nacional de Colombia 2021.
  
  Correo: maofigueroaca@unal.edu.co
  
  
  

• 

  Claudia Lorena Cruz Hernández

  Estudiante de Maestría en Ciencias Microbiología.

  Bacterióloga y laboratorista clínica
  
  Joven talento en investigación e innovación
  
  Pertenece al grupo de investigación en obesidad y diabetes en Iberoamérica: factores de riesgo y nuevos biomarcadores patógenos y predictivos
  
  Correo: clcruzh@unal.edu.co
  
  
  

• 

  Ginneth Lorena Riaño Ayala

  Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímica

  Licenciada en Química
  
  Joven talento en investigación e innovación
  
  Pertenece al grupo de investigación en obesidad y diabetes en Iberoamérica: factores de riesgo y nuevos biomarcadores patógenos y predictivos
  
  Correo: griano@unal.edu.co
  
  
  

• 

  Sergió Dávila

  Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímica

  Químico - Universidad Nacional de Colombia
  
  Areas de investigación: Bilogía molecular, bioquímica, Metrología química, bioanálisis, inmunoensayos, micrología
  
  Correo: sldavilag@unal.edu.co
  
  
  

• 

  Laura Marcela Gómez Alfonso

  Estudiante de Maestría en Ciencias-Microbiología

  Bacterióloga egresada de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca (2015)
  
  Bacterióloga egresada de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca (2015)
  
  Correo: lgomezalf@unal.edu.co
  
  
  

Estudiantes de Pregrado

• 

  Danna Sofia Camelo Gomez

  Estudiante de Biología

  Correo: dscamelog@unal.edu.co

• 

  Alver Cruz

  Estudiante de Biología

  Correo: lacruzca@unal.edu.co

• 

  Lucas Andres Cervantes Herrera

  Estudiante de Biología

  Correo: lcervantesh@unal.edu.co

• 

  Edgar Alfredo Diaz Perez

  Estudiante de Biología

  Correo: edadiazpe@unal.edu.co

• 

  Sergio Nicolas Ricaurte Ruiz

  Estudiante de Química

  Correo: snricaurter@unal.edu.co

• 

  Julieth Daniela Buell Acosta

  Estudiante de Medicina

  Correo: judacostabo@unal.edu.co

• 

  Haiver Antonio Rodríguez Navarro

  Estudiante de Medicina

  Correo: haarodriguezna@unal.edu.co

Egresados

Egresados Destacados

• 

  Lorena Novoa

  Pregrado (2009). Búsqueda, Amplificación y Clonación de Genes que Codifican para una Enzima ATPasa y el Regulador MgtC de Mycobacterium tuberculosis
  
  Maestría (2012). Análisis bioinformático y desarrollo de útiles génicos para la caracterización molecular in vitro de un posible transportador de cationes alcalinos o alcalinotérreos de la membrana plasmática de Mycobacterium tuberculosis
  
  Doctorado (2017). Potencial de las ATPasas tipo P como dianas terapéuticas o en el diseño de mutantes atenuados de Mycobacterium tuberculosis
  
  
  
  

• 

  Andrés Felipe León

  Pregrado (2010). Evaluación de una posible contaminación por transferencia de genes de resistencia antibiótica en muestras ambientales de la sabana de Bogotá
  
  Maestría (2013). Clonación y determinación de la especificidad iónica de CtpA, una ATPasa tipo P encargada de transportar metales pesados a través de la membrana plasmática de Mycobacterium tuberculosis.
  
  Doctorado (2018). Respuesta de las ATPasas tipo P1B a las condiciones de estrés en Mycobacterium tuberculosis
  
  
  
  
  
  

• 

  Paola Andrea Santos Ruiz

  Maestría (2010). Sistema de transporte ATPasa en vesículas de membranas de Mycobacterium tuberculosis involucrado en la regulación de la concentración de protones: posible blanco terapéutico de la acción de péptidos antimicrobianos
  
  Doctorado (2020). ATPasas tipo P de Mycobacterium tuberculosis como dianas para el diseño racional de compuestos antituberculosos
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  

• 

  Carlos Mario Ayala Torres

  Pregrado (2012). Potencial zeta, movilidad electroforética y composición de la superficie de Mycobacterium tuberculosis, características posiblemente involucradas en la formación de biopelículas y en la motilidad durante el proceso de adhesión a superficies
  
  Maestría (2015). Clonación, sobreexpresión y determinación de la especificidad iónica de Pma1, una posible Na+/K+ ATPasa de Mycobacterium smegmatis

  
  
  
• 

  Jimmy Esneider Rodríguez

  Pregrado (2010). Detección del estado metabólico, actividad ATPasa en membrana plasmática e influencia del regulador Mgtc en la homeostasis iónica de Mycobacterium cultivado en condiciones de estrés
  
  Maestría (2012). Transcripción de genes relacionados con la biosíntesis de sulfolípido y poliaciltrehalosas en Mycobacterium tuberculosis y detección de su estado metabólico bajo condiciones experimentales de latencia

• 

  Bibiana Chavarro Portillo

  Doctorado (2014). Estudio de cepas de Mycobacterium leprae colombiano causantes de multíples episodios sintomáticos de lepra post poliquimioterapia.

• Profesional
  Titulo
  Trabajo de Grado
  Año

• Epifanía Arango
  Práctica de investigación
  CtpB is a plasma membrane copper (I) transporting P-type ATPase of Mycobacterium tuberculosis
  2020
• Sandra Milena Chingaté Lopez
  Doctorado
  Péptidos análogos a Catelicidinas: potencial actividad e interacción con la envoltura celular de las micobacterias
  2019
• Maestría
  Diseño, síntesis y evaluación “in vitro” de análogos de péptidos antimicrobianos con potencial actividad como compuestos antituberculosos
  2012
• Carolina Villamil
  Maestría
  Desarrollo de herramientas de aseguramiento metrológico para la identificación y cuantificación de Salmonella spp. por métodos basados en PCR
  2019
• Jessica González
  Pregrado
  Perfil glicolipídico de Mycobacterium smegmatis defectivo en la proteína Pma1, homóloga de la ATPasa tipo P, CtpF, de Mycobacterium tuberculosis, y desarrollo de útiles génicos para la construcción de un doble mutante CtpF y Mmpl7 de Mycobacterium tuberculosis
  2018
• Laudy Viviana Quitian
  Maestría
  Determinación de características funcionales de CtpG, una ATPasa tipo P transportadora de metales pesados a través de la membrana plasmática de Mycobacterium tuberculosis
  2017
• Laura Gil
  Pregrado
  Desarrollo de útiles génicos para la construcción de un mutante de Mycobacterium smegmatis defectivo en el gen MSMEG_5014, relacionado con el transporte de cobre mediado por ATPasas tipo P
  2016
• Laura Margarita Perilla
  Maestría
  Búsqueda del vector de fitoplasmas del grupo 16SrDNA VII en insectos de la superfamilia Membracoidea (Hemiptera, Auchenorryncha) y de marcadores genómicos del patógeno relacionados con su transmisión
  2014
• Estephanie Valencia
  Pregrado
  Comportamiento transcripcional de las ATPasas tipo P de Mycobacterium tuberculosis en respuesta a concentraciones tóxicas de cationes de metales pesados
  2013
• Miyer Fabián Patiño Ruiz
  Maestría
  Evaluación preliminar de la especificidad iónica de la proteína CtpH expresada en Escherichia coli: ATPasa tipo P de Mycobacterium tuberculosis
  2013
• John Emerson Leguizamón Guerrero
  Maestría
  Búsqueda de marcadores genómicos y lipídicos de Mycobacterium colombiense, una micobacteria potencialmente virulenta perteneciente al complejo MAC
  2012
• Pregrado
  Búsqueda de marcadores genómicos de Mycobacterium colombiense, una especie potencialmente virulenta perteneciente al complejo MAC
  2008
• Jenifer Cuesta Bernal
  Maestría
  Clonación y expresión en Escherichia coli del gen ctpE Rv0908) de Mycobacterium tuberculosis: determinación preliminar de su posible actividad Na+ATPasa
  2012
• Pregrado
  Caracterización y efecto producido por las condiciones de hipoxia e inanición en la actividad Na+ ATPasa de bacterias del género Mycobacterium
  2010
• Juan Nicolas Tarquino
  Maestría
  Determinación del perfil lipídico y marcadores génicos asociados a biopelículas en Mycobacterium colombiense. Posible efecto del autoinductor I (AI-I) involucrado en comunicación bacteriana mediante Quorum sensing
  2011
• Pregrado
  Análisis de la capacidad de formación de biopelículas y el contenido de GPL como medida del carácter invasivo de Mycobacterium colombiense
  2010
• Isabel Alejandra Galeano Castillo
  Pregrado
  Determinación de la Movilidad Electroforética y el Potencial Zeta de Micobacterias mediante Microelectroforesis
  2011
• Nicolás Federico Villamil Munévar
  Pregrado
  Influencia del regulador global de latencia DosR en la actividad ATPasa y Na+ / K+ ATPasa de Mycobacterium smegmatis
  2010
• Nelson Enrique Arenas Suarez
  Maestría
  Caracterización Hemolítica, Estructural y Filogénetica de la Proteína TlyA de Mycobacterium tuberculosis
  2009
• Paola Alejandra Pulido Calderón
  Maestría
  Evaluación de la actividad ATPasa de micobacterias en condiciones de hipoxia y bajo la sobreexpresión del regulador global de latencia de M. tuberculosis DosR
  2009
• Aldemar Gordillo
  Pregrado
  Descripción de la actividad Na+/K+ ATPasa en la membrana plasmática de micobacterias y su posible efecto en la homeostasis iónica e infección latente
  2009
• Diego Armando Badillo Sanchez
  Pregrado
  Estudio comparativo para la síntesis de un péptido tetramérico de alto peso molecular de Plasmodium falciparum
  2009
• Ana S. Ramírez
  Maestría
  Búsqueda de marcadores lipídicos relacionados con condiciones experimentales de latencia en micobacterias.
  2008

Reconocimientos

• Mención de Honor- Premio Nacional de Medicina. Academia Nacional de Medicina de Colombia, 2021
• Mejor Póster “First International Conference in Bioinformatics, Simulations and Modeling” (ICBSM). Talca (Chile),2015
• Mejor Trabajo-Área de Salud Humana y Animal “Primer Congreso Colombiano de Bioquímica y Biología Molecular”. Bogotá (Colombia),2014.
• Mejor Trabajo del “32nd Congress of the European Society of Mycobacteriology”.Lubeck (Alemania), Julio de 2011
• Mejor Presentación Oral - Área Clínica “XIX Congreso Latinoamericano de Microbiología”. Quito (Ecuador), 2008.
• Mejor Presentación Oral del “XIX Congreso Latinoamericano de Microbiología”.Quito (Ecuador), 2008.
• Mejor Presentación Oral-Área Clínica “XIX Congreso Latinoamericano de Microbiología”. Quito (Ecuador), 2008

Eventos

• X Meeting of the Latin American Society of Tuberculosis and other Mycobacteriosis. Monterrey, México (Virtual) (2021)
• 3nd Asian African Congress of Mycobacteriology. Irán (Virtual). 2021
• XLIV Congreso Nacional de Infectología y Microbiología Clínica. León,México. 2019
• XXXII Congreso Nacional de Bioquímica. Ixtapa,México. 2018
• Evento: 14th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases. Sitges,España.2018
• Tercer Congreso Colombiano de Bioquímica y Biología Molecular (C2B2). Bogotá, Colombia. 2018
• XXIV Congreso Latinoamericano de Microbiología. Santiago de Chile.2018.
• 1er Simposio de Investigación de Posgrados en Biotecnología UN. Bogotá, Colombia. 2017.
• Biomicroworld 2017. Madrid, España. 2017
• Bioiberoamerica 2016. Salamanca, España. 2016
• Segundo Congreso Colombiano de Bioquímica y Biología Molecular (C2B2). Medellín, Colombia.2016
• Gordon Research Conferences, Frontiers of Science (Cell Biology of Metals).Mount Snow in West Dover VT, USA,2015.
• World Congress on Infectious Diseases. Londres, Inglaterra. 2015
• VI International conference on environmental, industrial and applied microbiology. Barcelona, España. 2015
• First International Conference in Bioinformatics, Simulations and Modeling (ICBSM). Talca,Chile. 2015
• VII Meeting of the SLAMTB. Canelas, Brasil. 2014
• 35th Annual Congress of the European Society of Mycobacteriology. Viena, Austria. 2014
• V International conference on environmental, industrial and applied microbiology. Madrid, España, 2013
• International Congress Tuberculosis, Leprosy and Mycobacteriosis: Back to biblical times, today solutions. Bucaramanga,Colombia.2012.
• 33rd Annual Congress of the European Society of Mycobacteriology. Brasov, Rumania. 2012
• 112th General Meeting of the American Society for Microbiology. San Francisco, USA. 2012
• 3er Reunión Regional y 1er Congreso Lationoamericano de Ciencias Microbiológicas. Puebla, México. 2011
• 32nd Annual congress of the European Society of Mycobacteriology. Lübeck, Alemania. 2011.
• XXIX Congreso Latinoamericano de Química. Cartagena, Colombia. 2010.
• XXI Semana de la Química. La investigación: un proceso de formación académica conducente a la acreditación de alta calidad. Bogotá, Colombia. 2010
• XX Congreso Latinoamericano de Microbiología. Montevideo, Uruguay. 2010.
• VII encuentro nacional de investigación en enfermedades infecciosas. Paipa, Colombia. 2010
• IV Meeting SLAM-TB (Sociedad Latinoamericana de Tuberculosis y otras Micobacteriosis). Rosario,Argentina. 2009.
• 29th Annual Congress of the European Society of Micobacteriology. Sofia, Bulgaria. 2008.
• First International Congress: Mycobacteria, a Challenge for the XXI Century. Bogotá, Colombia.2008
• XIX Congreso Lationoamericano de Microbiología. Quito, Ecuador.2008